Высокая чувствительность камер смартфона вместе с их возможностями подключения, GPS и производительностью обработки данных сделала их привлекательным инструментом для диагностики
В новом исследовании, опубликованном в научном журнале Cell, команда ученых описала технологию теста на COVID-19 на базе CRISPR, который использует камеру смартфона для обеспечения точных результатов в течение 30 минут.
Технология была разработана в сотрудничестве с биоинженером доктором наук Беркли Даниэлем Флетчером, и Дженнифер Дудна, доктором наук, которая получила Нобелевскую премию по химии в 2020 году за совместное открытие геномной инженерии CRISPR-Cas, сообщает Science Daily.
Их тест не только может диагностировать наличие вируса, он также измеряет концентрацию SARS-CoV-2 в образце.
Текущие тесты на COVID-19 используют метод ПЦР – золотой стандарт тестирования. Однако, одна из проблем при использовании этой технологии для теста на SARS-CoV-2 – то, что она требует ДНК. Коронавирус – РНК-вирус, что означает, что для использования подхода ПЦР, вирусная РНК должна быть конвертирована в ДНК. Кроме того, эта технология полагается на двухступенчатую химическую реакцию, включая стадию усиления для обеспечения достаточного количества ДНК, чтобы ее было заметно. Так что, текущие тесты требуют специальные реагенты и громоздкое лабораторное оборудование, что сильно ограничивает его реализацию.
В качестве альтернативы ПЦР ученые разрабатывают стратегии тестирования, которое базируется на генной технологии CRISPR, которая конкретно идентифицирует генетический материал.
Любая CRISPR-диагностика на данный момент требовала, чтобы вирусная РНК была конвертирована в ДНК и усилена перед тем, как ее можно будет определить. По контрасту, новый подход, описанный в этом недавнем исследовании, пропускает все стадии конверсии и усиления, используя CRISPR для прямого определения вирусной РНК.
Читайте еще: FDA одобрило тестирование одновременно на COVID-19 и грипп со сбором образцов дома
В новом тесте, протеин Cas13 комбинируется с молекулой, которая стает флуоресцентной при рассекании, и смешивается с образцом пациента из носового мазка. Образец помещается в устройство, которое присоединяется к смартфону. Если образец содержит РНК SARS-CoV-2, Cas13 активируется и рассекает молекулу, вызывая флуоресцентный сигнал. Потом камера смартфона, конвертируемая в микроскоп, может засечь свечение и доложить о позитивном тесте на вирус.
Исследователи говорят, что этот подход можно адаптировать к различным мобильным телефонам, упрощая доступ к технологии.
Когда ученые тестировали свое устройство, используя образцы пациентов, они подтвердили, что оно может обеспечить очень быстрый результат для образцов с клинически соответствующей вирусной долей. На самом деле, устройство точно определило набор позитивных образцов менее, чем за 5 минут. Для образцов с низкой вирусной долей устройству требовалось до 30 минут, чтобы отличить их от негативного теста.
Новый тест на базе CRISPR не только предлагает многообещающую опцию для быстрого тестирования, но благодаря использованию смартфона и отсутствию необходимости в громоздком лабораторном оборудовании, у него есть потенциал стать переносным и, в конечном итоге, доступным даже для домашнего использования. Также он может использоваться для диагностики других респираторных вирусов, не только SARS-CoV-2.