Обнаружены новые биомаркеры, которые могут спрогнозировать продолжительность и вероятность ослабления ВИЧ-инфекции после прерывания лечения, то есть антиретровирусной терапии (АРТ)
Прерывание АРТ проводится в рамках клинических испытаний с целью поиска и разработки новых путей излечения.
Такие биомаркеры также могут объяснить, при помощи каких биологических механизмов контролируется репликация ВИЧ по окончании терапии, что также поможет разработать новое лечение против ВИЧ, пишет sciencedaily. Американские ученые из института Вистар нашли в крови редких ВИЧ-инфицированных людей метаболические и гликомические признаки, которые могут естественным путем подавлять вирус после прекращения АРТ. Такие пациенты называются пост-терапевтические контроллеры.
Клинические испытания проверили новые вероятные методы терапии для ликвидации ВИЧ-инфекции. Согласно протоколу испытаний, участники прошли аналитические терапевтические вмешательства (АТВ), при которых исследователи анализируют их состояния без АРТ. Дело в том, что при АРТ ВИЧ нельзя определить, но в большинстве случаев вирусная нагрузка повышается в течении нескольких дней или недель после прекращения АРТ и требует тщательного наблюдения. На данный момент не существует простых неинвазивных методов наблюдения за вирусом после АТВ. Для этого и нужны были биомаркеры для улучшения безопасности за счет прогнозирования того, как долго пациент может находиться без АРТ, а также для понимания механизмов контроля вируса после АРТ.
Читайте еще: Грипп затаился – однако не исчез, а ждет своего часа
В исследовании изучили образцы крови двух групп ВИЧ-инфицированных пациентов. В первой группе было 24 пациента, которые прошли АТВ без иммунорегулирующих препаратов, а во второй – 74 пациента, которые тестировали различные вакцины и иммунотерапии. Их кровь проанализировали на наличие и количество определенных молекул, образующихся в результате клеточного метаболизма, называемых метаболиты, и белков, к которым присоединены молекулы сахара, – гликопротеины. Метаболиты и гликопротеины выходят из различных тканей и попадают в кровоток, поэтому их количество и химические характеристики отображают общее состояние разных органов, что делает их отличными кандидатами для биомаркеров.
Вначале ученые провели метаболомный анализ образцов первой группы и определили состав метаболитов, связанных с воспалением, чей уровень до АТВ совпадает по времени с возвращением вируса. Эти наблюдения подтвердились в анализах реактивации вируса in vitro. Далее они провели метаболомный анализ у второй группы, включив гликомическое исследование измерения уровня сахарных белков. Поскольку в эту группу также входили пациенты пост-терапевтические контроллеры, то ученые смогли подтвердить свои наблюдения, сравнив две группы.
С помощью алгоритмов машинного обучения, они объединили идентифицированные биомаркеры, чтобы создать две модели для прогнозирования вероятности и продолжительности реактивации вируса с точностью 95% и 74% соответственно.