Команда исследователей обнаружила, что инновационный протокол, при котором образцы слюны обрабатываются бисерным мельничным гомогенизатором до ПЦР-теста, приводит к более высокой чувствительности
Сбор назофарингальных образцов для диагностики COVID-19 включает риск заражения для медработников. Образцы слюны легче собрать, но они могут быть смешаны со слизью или кровью, и, по данным некоторых исследований, они дают менее точный результат. Новая работа ученых помогла решить эту проблему.
«Использование слюны как типа образца для теста на COVID-19 значительно продвинуло нас в борьбе с пандемией. Это помогло нам более эффективно собирать образцы для тестирования и подвергать медработников меньшему риску», – сказал ведущий исследователь Равиндра Колхе, доктор медицинских наук из университета Аугуста в Джорджии, США, сообщает Science Daily.
Исследование включило образцы из больницы и дома престарелых. В первой фазе, 240 соответствующих назофарингальных образцов и образцов слюны тестировались на РНК SARS-CoV-2 методом ПЦР. Во второй фазе, 189 соответствующих пар, включая 85 раннее оцененных в первой фазе, обработали в бисерном мельничном гомогенизаторе Omni перед ПЦР-тестированием.
Было проведено дополнительное исследование с образцами обеих фаз для определения, влияет ли бисерный гомогенизатор на клиническую чувствительность назофарингальных образцов. В конце, была оценена стратегия выборки. Двадцать позитивных выборок, содержащих один позитивный и четыре негативных образца, были обработаны бисерным гомогенизатором Omni до выборки на ПЦР-тестирование на SARS-CoV-2 и сравнения с контрольными образцами.
В первой фазе 28,3% образцов были тестированы позитивно на SARS-CoV-2. Уровень определения для слюны был ниже по сравнению с назофарингальными образцами (50% против 89,7%). Во второй фазе позитивно было тестировано 50,2% всех образцов. Уровень определения был выше для слюны (97,8% против 78,9%). Из 85 образцов слюны, тестированных обоими протоколами, уровень определения был 100% для второй фазы и 36,7% для первой.
Доктор Кохле заметил, что причиной более низкой чувствительности слюны для ПЦР-тестирования могла быть гелеподобная консистенция образцов слюны, что затрудняло их аккуратный забор пипеткой для экстракции нуклеиновой кислоты. Добавление стадии гомогенизации привело слюну к однородной вязкости и консистенции, что упростило забор.
Читайте еще: Вся правда о противовирусных препаратах
«Мониторинг SARS-CoV-2 остается необходимостью для общественного здравоохранения», – сказал доктор Кохле. – «Использование неинвазивных методов сбора и легкодоступных образцов, таких, как слюна, усилит активность скрининга и наблюдения, и исключит необходимость в стерильных ватных палочках, дорогих перевозках и риске заражения, и даже необходимость квалифицированных медработников для забора образцов».