В новой работе исследователи сообщают о разработке и тестировании анализатора дыхания, известного как Бабблер, опирающегося на определение вирусной РНК для диагностики SARS-CoV-2
Название образовано из булькающего звука, который происходит, когда пациент дышит в устройство.
Бабблер представляет собой стеклянную трубку с пипеткой, через которую пациенты выдыхают воздух для тестирования. Трубка наполнена реактивной смесью для обратной транскрипции и холодным минеральным маслом.
Бабблер не только обратно транскрибирует РНК из воздушных частиц вируса в ДНК, но также может наносить штрих-код на эту ДНК, позволяя использовать образцы для секвенирования. Этот тест можно использовать для предоставления дополнительной информации, такой, как вирусная нагрузка и штамм.
Определение вируса Бабблером подобно клиническому ПЦР-тесту с ватной палочкой, однако Баллбер лучше измеряет вероятность заражения, поскольку определяет воздушные вирусные частицы. Бабблер можно также адаптировать для тестирования воздуха в больницах и замкнутых помещениях.
В ходе нового исследования были обследованы 70 пациентов, которые лечились в отделении скорой помощи больницы Род-Айленда с мая 2020 по январь 2021. Ученые проверили образцы с трех точек респираторного тракта. Мазки с языка и образцы воздуха сравнили с обычным носоглоточным ПЦР-тестом ватной палочкой, сообщает ScienceDaily.
Исследователи выяснили, что SARS-CoV-2 можно напрямую определять в дыхании. Вирусная РНК более обогащена в дыхании по сравнению с оральными образцами, а оральные образцы содержат клетки, включенные в репликацию SARS-CoV-2, которых нет в дыхательных образцах. Это предполагает, что вирусный сигнал, определенный в Бабблере, происходит из активных вирусных частиц.
Исследователи также продемонстрировали, что Бабблер можно адаптировать для определения вируса в воздушных образцах. Чтобы смоделировать движение выдыхаемых капелек, три уникальных образца нуклеиновой кислоты были добавлены к трем увлажнителям в различных локациях на разном расстоянии от Бабблера в комнате с высоким воздушным потоком и в комнате с низким воздушным потоком. Хотя детальное изучение такого применения не входило в исследование, результаты демонстрируют потенциал для использования распыленной в воздухе нуклеиновой кислоты для количественного определения воздушного потока в помещении, и для выявления SARS-CoV-2 в воздухе.
Читайте еще: Как не подхватить новый вирус в новогодний отпуск
Тесты на COVID-19 обычно используют образцы, собранные из верхних дыхательных путей. Позитивные образцы содержат активный вирус, но вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях не коррелирует с симптомами в нижних дыхательных путях, таких, как пневмония.