У «Омикрона» 10 мутаций в области присоединения рецептора по сравнению с двумя у варианта «Дельта»
Новый штамм коронавируса Омикрон (B.1.1.529) был обнаружен исследователями в Южной Африке 24 ноября и назван «тревожным вариантом» Всемирной организацией здравоохранения два дня спустя. Омикрон очень необычен тем, что он на данный момент наиболее мутировавший вариант SARS-CoV-2.
Вариант Омикрон имеет в целом 50 мутаций, 32 из них – на шиповом протеине. Шиповый протеин помогает вирусу цепляться за клетки.
Для сравнения, у штамма Дельта – 9 мутаций. Большее количество мутаций у варианта Омикрон может означать, что он может быть более заразным и/или лучше избегать иммунной защиты.
По словам Суреш В. Кучипуди – вирусолога, изучающего возникающие и зоонозные вирусы, условия, приведшие к возникновению варианта, пока не ясны, но понятно, что само по себе количество и конфигурация мутаций у Омикрона необычны, пишет ScienceAlert.
Через естественный отбор, случайные мутации накапливаются у любого вируса. Этот процесс ускорен у РНК вирусов, включая SARS-CoV-2. Если набор мутаций предоставляет варианту преимущества для выживания, он превзойдет все остальные существующие варианты вируса.
Одно из возможных объяснений, как возникают вирусные варианты с множеством мутаций – через продолжительную инфекцию у пациента, чья иммунная система подавлена: такая ситуация может привести к быстрой вирусной эволюции.
Исследователи предположили, что некоторые из ранних вариантов SARS-CoV-2, например, вариант Альфа, могли появиться у постоянно инфицированного пациента. Однако, необычные и многочисленные мутации у варианта Омикрон сильно отличают его от всех остальных штаммов, что поднимает вопрос о его происхождении.
Другой возможный источник вариантов – животные хозяева. SARS-CoV-2 может инфицировать некоторые виды животных, включая ласок, тигров, львов, котов и собак.
К слову, вариант Дельта на 40-60% более заразен, чем Альфа, и почти вдвое заразнее оригинального вируса, впервые определенного в Китае. Повышенная заразность штамма Дельта – первая причина того, что он может превосходить другие варианты и стать доминирующим.
Ключевой фактор жизнеспособности вируса – его скорость репликации, то есть как быстро он может воспроизводить свои копии. Вариант Дельта реплицирует быстрее предыдущих вариантов SARS-CoV-2, по оценкам исследователей, он производит в 1000 раз больше вирусных частиц, чем его предшественники.
Кроме того, люди, инфицированные этим вариантом, производят и высвобождают больше вируса, что еще больше повышает его способность распространяться.
Одно из возможных объяснений этого – мутации шипового протеина у варианта Дельта привели к более эффективному присоединению к клеткам хозяина.
Вариант Дельта также получил мутации, позволяющие ему избегать нейтрализующие антитела, играющие критическую роль в защите от вируса. Это может объяснить, почему, по результатам многочисленных докладов, вакцины против COVID-19 несколько менее эффективны против варианта Дельта.
Читайте еще: АМКУ признал, что ошибочно пытался оштрафовать производителя противовирусного препарата
Пока слишком рано утверждать, что вариант Омикрон более жизнеспособен, чем Дельта, и станет доминирующим. У варианта Омикрон есть некоторые мутации, совпадающие с Дельтой, но другие совершенно отличны, утверждают ученые.