AY.4.2 – то, что называется «производной». Такие ярлыки присваивают ответвлениям эволюционного древа COVID, чтобы показать их родство. Проследить происхождение AY.4.2 можно. Что и сделала команда британских ученых из университета Нортумбрии секвенировав два образца
Как известно, в апреле этого года в Индии циркулировала производная вируса – B.1.617. Однако эти варианты отличались в мутациях генетического материала. В мутациях выбранных образцов отсутствовали некоторые характерные для B.1.617мутации, но присутствовали другие дополнительные, пишет sciencealert. Эти образцы классифицировали как B.1.617.2, то есть производную B.1.617, впоследствии названной Всемирной организацией здравоохранения Дельтой.
AY – это следующий эволюционный шаг вируса. Чтобы название не становилось слишком громоздким, после пяти изменений производную маркировки меняют на новую комбинацию букв. Так что форма вируса AY не слишком отличаются от предыдущих, несмотря на разные буквы. Все они являются дочерними производными от Дельты. На данный момент идентифицировано 75 производных AY, каждая из которых имеет разные дополнительные определяющие мутации в геноме. Пропорциональность одного из них – AY.4 – неуклонно растет в Великобритании за последние несколько месяцев. На нее приходится 63% новых случаев за последние 28 дней.
Учитывая растущее доминирование AY.4 в Великобритании, эта мутация может иметь селекционное преимущество. Определяющим изменением AY.4 является мутация A1711V – она влияет на вирусный белок Nsp3, который играет роль в репликации вируса. Однако, пока влияние этой мутации неизвестно.
Читайте еще: Что такое иммунная система. Как укрепить иммунитет
Далее приходит новая дочерняя производная AY.4 – AY.4.2, ее впервые заметили в конце сентября, хотя, похоже, что она появилась в Великобритании еще в июне. Она выделяется двумя дополнительными генетическими мутациями: Y145H и A222V, которые влияют на спайковый белок (часть внешней поверхности вируса, с помощью которой он попадает внутрь клеток).
Заболеваемость AY.4.2 также выросла и за последние 28 дней составляет 9% случаев в Великобритании. AY.4.2 также встречается в других европейских странах: Дании, Германии, Ирландии и пр. Дают ли эти две мутации селекционное преимущество вирусу, все еще неясно. Например, A222V раньше появилась от B.1.177 в Испании и потом распространилась отдыхающими по северной Европе.
В то время многие скептически относились к A222V. В самом деле, распространение вируса, получившего название AY.4.2, по-видимому, произошло только после того, как он получил мутацию Y145H. Эта мутация обитает в шипе белка. Ученым известно, что эта часть уже была однажды модифицирована мутацией в генетическом материале Дельты, и это, вероятно, способствует Дельте хорошо избегать иммунитета, поскольку в результате антителам труднее нацеливаться на вирус.
Еще слишком рано говорить, является ли это началом следующей доминирующей линии передачи. Любая способность вируса избегать иммунитета должна быть подтверждена экспериментально. Однако очевидно, это появление доказывает, что существует постоянная потребность в геномном наблюдении за вирусом.