Возможно, теперь удастся прогнозировать опасность новых разновидностей SARS-CoV-2
Вспышки коронавирусов периодически происходили, но ни одна из них не была столь разрушительной, как пандемия COVID-19.
Вивек Говинд Кумар и его коллеги из лаборатории Махмуд Моради университета Арканзаса, открыли одну из причин, которая, вероятно, делает SARS-CoV-2 намного более заразным, чем SARS-CoV-1, который вызвал вспышку SARS в 2003 году, сообщает Science Daily.
Первый шаг инфекции коронавируса – вхождение вируса в клетки. Для этого шиповые протеины снаружи вируса SARS-CoV должны перераспределиться. Ученым известны позиции «неактивного» и «активного» состояний шиповых протеинов вирусов и SARS-CoV-1, и -2, но Моради и его коллеги хотели изучить, как шипы передвигались из одной позиции в другую и динамику этих передвижений. Они обратились к молекулярным симуляциям, выполненным в Техасском центре продвинутых вычислений и Питтсбургском суперкомпьютерном центре.
«Мы открыли в этих симуляциях, что SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 совершенно по-разному меняют форму и делают это в течении разного времени», – говорит Моради. – «SARS-CoV-1 двигается быстрее, он активируется и дезактивируется, что не оставляет ему много времени, чтобы присоединиться к человеческой клетке, поскольку он не стабилен. SARS-CoV-2, с другой стороны, стабилен и готов к атаке», – добавил он.
На конце шипа есть участок, который обычно игнорировался в исследованиях, говорит Моради, но этот участок важен для стабильности протеина. Мутации в этом участке могут повлиять на заразность, и на них следует обратить внимание.
Читайте еще: Лезет в душу и сводит с ума: как COVID-19 влияет на психику
Другое применение их исследования – то, что они «смогли разработать терапию, которая изменяет динамику и делает неактивное состояние более стабильным, таким образом, способствуя дезактивации SARS-CoV-2. Такая стратегия еще не применялась», – объясняет Моради.
Производить такие симуляции очень полезно, говорит Моради. В случае, если появляется новый вариант коронавируса, или мутирует SARS-CoV-2, можно прогнозировать, будет ли новый вирус или вариант более заразным.
Теперь ученые начали изучать новый вариант SARS-CoV-2, B.1.1.7, в лаборатории, чтобы определить различия в его движениях.