Команда ученых под руководством Тюдора Опреа из университета Нью-Мехико создала уникальный инструмент, позволяющий разработчикам лекарств быстро определять молекулы, способные нейтрализовать вирус до проникновения в человеческие клетки или на ранних стадиях инфекции
В работе, опубликованной в Nature Machine Intelligence, исследователи презентовали REDIAL-2020, открытый онлайн источник вычислительных моделей, которые помогут ученым быстро сканировать мелкие молекулы на их потенциал в борьбе с COVID, сообщает Science Daily.
«Это в некоторой степени заменяет лабораторные эксперименты», – говорит Опреа. – «И сужает поле для фокусировки. Поэтому мы поместили его онлайн, чтобы все могли им пользоваться».
В то время, как ученые публиковали данные прошлой весной относительно переназначения существующих лекарств для COVID, они обнаружили, что у них достаточно данных для построения основательных моделей для машинного обучения.
Исследователи в области биомедицины обычно фокусируются на положительных результатах, но в данном случае, ученые также сообщали, у каких молекул нет эффекта борьбы с вирусом. Включение отрицательных данных усиливает точность машинного обучения, по словам Опреа.
«Идея в том, что мы определяем молекулы, подходящие под идеальный профиль», – говорит он. – «Нам нужно найти молекулы с определенной активностью».
«Коронавирус – коварный противник. Не думаю, что существует один полностью подходящий препарат».
Вместо этого, исследователи, вероятно, разработают коктейль из множества лекарств, атакующий вирус на различных фронтах.
Читайте еще: Чи можна повторно заразитися СOVID-19: нові штами, хвороба після вакцини і клітинний імунітет
REDIAL-2020 базируется на алгоритмах машинного обучения, способных быстро обрабатывать огромные массивы данных и вычленять скрытые паттерны, которые человек, возможно, не воспринимает. Команда Опреа подтвердила прогнозы машинного обучения, сравнив данные исследовательского центра с известными эффектами одобренных лекарств базы данных университета Нью-Мехико.
В принципе, этот вычислительный процесс гибок и его можно натренировать оценивать элементы против других патогенов, а также оценивать химикаты, еще не одобренные для использования на людях.