Это обнаружили исследователи из университета Гете совместно с коллегами из международного консорциума COVID-19-NMR
С помощью специализированных библиотек веществ, они определили несколько мелких молекул, присоединяющихся к определенным участкам генома SARS-CoV-2, которые практически никогда не изменяются при мутациях.
Когда SARS-CoV-2 инфицирует клетку, он вводит в нее свою РНК и перепрограммирует ее таким образом, что клетка вначале производит вирусные протеины, а потом целые вирусные частицы. В поиске активного вещества против SARS-CoV-2, исследователи до сих пор в основном концентрировались на вирусных протеинах и блокировании их, поскольку это должно предотвратить или хотя бы замедлить репликацию. Но атака вирусного генома, длинной молекулы РНК, также может остановить или замедлить вирусную репликацию, пишет sciencedaily.com
Ученые консорциума COVID-19-NMR, координируемого профессором Харальдом Швальбе из института органической химии и химической биологии в университете Гете, завершили важный первый шаг в разработке такого нового класса препаратов против SARS-CoV-2. Они определили 15 коротких сегментов генома SARS-CoV-2, которые весьма схожи у различных коронавирусов, и, как известно, выполняют важную регуляторную функцию. На протяжении 2020 эти сегменты очень редко подвергались мутациям.
Исследователи подвергли библиотеку веществ из 768 мелких химически простых молекул взаимодействию 15 сегментов РНК и проанализировали результат методом ЯМР-спектроскопии. При ЯМР-спектроскопии молекулы вначале помечаются особым типом атомов (стабильными изотопами), а затем подвергаются действию сильного магнитного поля. Атомные ядра возбуждаются под действием короткого радиочастотного пульса и выделяют частотный спектр, при помощи которого возможно определить РНК и протеиновую структуру, и как и где связываются мелкие молекулы.
Читать еще: Врач рассказала, почему после длительного карантина нужно оздоровить ребенка
Это позволило исследовательской команде, возглавленной профессором Швальбе, идентифицировать 69 мелких молекул, которые присоединяются к 13 из 15 РНК-сегментов. По словам профессора Харальда Швальбе, «три из молекул даже присоединяются конкретно к одному сегменту РНК. Таким образом, мы смогли показать, что РНК SARS-CoV-2 весьма подходящая как потенциальная цель для медикаментов. С оглядкой на множество мутаций SARS-CoV-2, такие консервативные сегменты РНК, подобно определенным нам, особенно интересны для разработки потенциальных ингибиторов. И, поскольку вирусная РНК занимает до двух третей всей РНК в инфицированной клетке, мы сможем нарушить вирусную репликацию в значительной мере, используя подходящие молекулы». На этом фоне, продолжает Швальбе, исследователи уже начали последующие испытания с уже доступными веществами, химически сходными с присоединяющимся агентам из библиотеки веществ.